宏转录组学
宏转录组(Metatranscriptome)测序是指从整体水平上研究某一特定环境,特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律的研究手段,它以RNA为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。获取微生物组总RNA并去除rRNA之后,反转录为cDNA,并构建合适长度的插入片段文库,对这些文库进行双端(Paired-end,PE)高通量测序,从而能精确定量整个菌群中具有活性的物种精细组成及其对应功能的表达水平,进而锁定菌群中的关键生物标记物、阐明其生物学意义。
实验流程
样品要求
1. RNA:浓度≥100 ng/μL,总量≥4 μg,并确保RNA无降解;
2. cDNA:浓度≥20 ng/μL,总量≥1 μg,必须是双链cDNA;
3. 土壤、污泥等原样,至少提供1.5g;
4. 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封;
5. 样品保存期间切忌反复冻融,送样时使用干冰运输。
交付内容
检测报告(含测试流程,仪器型号等),交付时间4-6周,结果反馈请在测试完成一周内反馈给指南针工作人员。
1·提交需求
2·沟通细节
3·付款确认
4·下载结果